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X1000 · 单微生物研究

从微生物个体,
研究群体中的差异。

以微流控分配、反应与条码关联构建单微生物基因组研究路径,为群体异质性提供个体层面的观察。

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X1000 单微生物平台 · 产品展示图

研究问题

个体差异与序列来源。

01 / 遗传差异

个体之间有哪些遗传差异?

围绕微生物个体获取序列信息,研究群体内部的基因组多样性。

02 / 序列归属

序列信息如何关联到个体?

借助分配和条码信息,研究序列的来源及其关联关系。

03 / 功能研究线索

差异能够提出哪些功能问题?

将基因组差异作为后续功能研究的线索,并通过独立实验进一步检验。

原理概览

从反应空间,
到序列来源。

微流控液滴为样本分配和独立反应提供空间。结合适配的裂解、扩增和条码步骤,将测序信息与其来源分区关联,再通过质量控制评估个体层面的基因组信息。

个体分离与分区

围绕目标微生物与样本条件,设计适合的悬液与分区方案。

裂解与扩增

评估裂解与基因组扩增等步骤对研究对象的适配。

来源关联与质控

结合条码、质量控制与分析方法,研究序列与个体的对应关系。

通过占据率控制、多重分配识别与扩增质控,筛选出可靠的单个体数据。

工作流

单微生物基因组研究工作流。

  1. 01

    样本准备

    评估样本基质与微生物对象,制备适合的悬液。

  2. 02

    分区与基因组反应

    开展相应液滴处理、裂解及基因组扩增。

  3. 03

    条码与文库

    连接片段化、条码关联与后续建库环节。

  4. 04

    测序与个体信息分析

    经外部测序后,结合质控、覆盖情况与分析方法解释数据。

系统与方案

仪器、反应方案与质量分析。

仪器与液滴处理

围绕微流控分配与相应反应环节组织实验过程。

配套反应方案

根据微生物对象评估处理和扩增条件,避免把不同生物对象视作同一种输入。

质量与分析

关注可用序列、覆盖与来源关联等研究所需指标,并按设计解释其限制。

RVQC® System(全系标配)

X1000 全系标配 RVQC® 视觉实时质控系统(Real-Time Visual Quality Control System),通过实时视觉识别监测关键液滴状态。

开始一项研究

微生物对象与样本可行性。

讨论可以从三件事开始:样本来自哪里、重点研究哪些微生物、希望回答什么问题。我们据此评估样本处理、反应适配与分析范围。

微生物个体与群落研究

适用于细菌等单微生物研究;病毒颗粒与感染宿主细胞可按项目评估。

评估微生物项目可行性

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