研究应用

肿瘤异质性与克隆研究

让遗传差异,回到具体的细胞。

同一样本中的细胞并不完全相同。单细胞靶向 DNA 与选定表面蛋白信息,为研究变异共现、克隆组成和表型差异提供互补线索。

研究问题

从“检测到变异”,进一步追问。

01

变异如何共现?

在方案覆盖的靶区内,研究不同变异是否出现在同一细胞,为遗传群体的区分与克隆组成分析提供信息。

02

克隆呈现什么表型?

将遗传信息与选定的表面蛋白信号关联,比较不同遗传亚克隆的蛋白表型,而不以一种标记替代整个细胞状态。

03

组成怎样改变?

在设计一致的取样时间或实验条件之间,比较细胞群体与克隆组成,形成可进一步验证的纵向研究线索。

测量与解释

同一细胞,连接两个研究维度。

D100 的 DNA + 蛋白方案围绕同一细胞中的靶向遗传信息与选定表面蛋白信号展开。

靶向 DNA

所覆盖位点的变异信息,以及细胞间的共现差异。

细胞来源关联

通过细胞条码关联读出,在质量评估后开展联合分析。

选定表面蛋白

方案所含标记的信号,为遗传群体提供对应的表型信息。

方案设计

靶区选择与分组设计。

  1. 01

    定义比较对象

    明确研究人群、样本分组、取样时间及关键问题,区分探索性观察与预先设定的分析目标。

  2. 02

    选择靶区与标记

    围绕研究目标选择 DNA 靶区与蛋白组合,评估覆盖范围、样本条件与所需对照。

  3. 03

    保持处理可比

    在不同组别或时间点间统筹样本处理与批次安排,记录可能影响细胞组成的前处理因素。

  4. 04

    审视质量与解释

    结合有效细胞、位点覆盖和蛋白信号质量理解结果;缺失信号、等位基因脱落与双细胞等因素需要纳入分析。

分析重点

克隆分析与结果解释。

可以组织怎样的分析?

围绕约定靶区与标记,分析细胞层面的变异共现、遗传群体组成,以及不同亚克隆的选定蛋白信号;在合理设计下比较组别或时间点。

哪些结论需要更多证据?

纵向取样可重建克隆演化关系;捕获细胞数越多,越能稳定检出低比例群体。

相关平台与服务

D100 平台与实验服务。