细胞状态、免疫与调控研究

从细胞组成，看向状态与调控。

细胞身份与状态共同塑造组织和群体的功能。单细胞转录研究提供表达层面的观察，适配的染色质研究进一步补充调控相关线索。

研究问题

细胞状态研究关注什么。

结合表达特征、标记与参考信息，研究细胞群体组成，比较样本之间的组成差异。

在细胞群体内部比较实验条件或样本组别，探索免疫应答、发育、应激及其他相关状态。

通过适配的 ATAC 研究观察染色质可及性，在明确实验关系的前提下与表达信息进行互补分析。

不同读出，不同问题

通过细胞条码与分子标记组织转录信息，研究细胞组成、基因表达与状态差异。具体可测内容由所选工作流决定。

染色质可及性提供另一类分子线索。开放区域本身不能单独证明具体调控作用或因果关系。

RNA 与 ATAC 可对应不同实验；同细胞联合方案需单独评估，当前处于优化阶段。

方案设计

分析重点

围绕质量评估、群体划分、细胞注释、差异表达或通路相关分析组织研究结果；具体分析内容随样本设计和服务方案确定。

表达或可及性变化可以提出机制假设，但不能单独证明细胞相互作用、抗原特异性或调控因果。需要功能实验的问题，应进入下一步验证。