区域差异
组织不同区域呈现怎样的表达格局?
ZYENRA-SPATIAL V2 · 空间条码芯片
用空间条码连接分子信号、位置与组织图像,围绕组织区域的表达格局开展研究。
当前评估范围:OCT 包埋的新鲜冷冻组织。预固定组织和 FFPE 不在当前接收范围内;空间 RNA 服务处于优化阶段,按项目评估。
组织位置、空间坐标与分子信息的对应关系。
研究维度
组织不同区域呈现怎样的表达格局?
分子信号与形态边界、组织结构有什么对应关系?
如何结合组织位置,研究局部细胞环境中的分子线索?
原理概览
01
芯片上的条码信息提供位置关联的基础。
02
在流程中保留组织形态信息,用于后续空间对应。
03
测序后将表达信息与空间条码相连,并结合组织图像开展研究分析。
V2 芯片版型
两种布局,共用 25 × 75 mm 载片尺寸。下图为版型示意,具体实验配置按项目确认。
版型 A
每区 15 × 5.5 mm,共 2 区。
165 mm²
合计捕获面积
版型 B
每区 10 × 10 mm,共 1 区。
100 mm²
合计捕获面积
ZYENRA-spatial v2 版型参数;实际分辨率取决于组织、扩散与分析设置。
工作流
从 OCT 包埋的新鲜冷冻组织出发,评估形态、RNA 质量与切片安排。
按工作流完成切片固定、组织成像与透化捕获。
通过配套反应与外部测序获取分子和条码信息。
结合空间条码与组织图像,研究区域表达及相应质量指标。
OCT 包埋的新鲜冷冻组织。送样前结合组织形态、RNA 质量、尺寸与切片条件讨论预实验。
样本要求与流程内固定是两件事:来样须为未固定的新鲜冷冻组织;切片上机后,流程本身包含固定步骤。当前方案不接收已固定或石蜡包埋样本。
先确认研究区域与样本适配,再讨论切片、成像、实验和分析条件。空间 RNA 服务处于优化阶段,按项目评估实施。
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