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ZYENRA-SPATIAL V2 · 空间条码芯片

让分子读出,
回到组织位置。

用空间条码连接分子信号、位置与组织图像,围绕组织区域的表达格局开展研究。

当前评估范围:OCT 包埋的新鲜冷冻组织。预固定组织和 FFPE 不在当前接收范围内;空间 RNA 服务处于优化阶段,按项目评估。

空间位置与分子读出概念示意
  1. 组织位置
  2. 空间坐标
  3. 分子信息

组织位置、空间坐标与分子信息的对应关系。

研究维度

区域表达、组织边界与微环境。

区域差异

组织不同区域呈现怎样的表达格局?

结构关联

分子信号与形态边界、组织结构有什么对应关系?

微环境

如何结合组织位置,研究局部细胞环境中的分子线索?

原理概览

让表达矩阵,
拥有位置参照。

01

空间条码

芯片上的条码信息提供位置关联的基础。

02

组织图像

在流程中保留组织形态信息,用于后续空间对应。

03

分子读出

测序后将表达信息与空间条码相连,并结合组织图像开展研究分析。

V2 芯片版型

按组织形状,
选择合适的捕获区域。

两种布局,共用 25 × 75 mm 载片尺寸。下图为版型示意,具体实验配置按项目确认。

版型 A

双捕获区布局

每区 15 × 5.5 mm,共 2 区。

165 mm²

合计捕获面积

版型 B

单方形捕获区

每区 10 × 10 mm,共 1 区。

100 mm²

合计捕获面积

ZYENRA-spatial v2 版型参数;实际分辨率取决于组织、扩散与分析设置。

工作流

从组织切片到空间分析。

  1. 01

    评估与切片

    从 OCT 包埋的新鲜冷冻组织出发,评估形态、RNA 质量与切片安排。

  2. 02

    固定、成像与捕获

    按工作流完成切片固定、组织成像与透化捕获。

  3. 03

    反转录、建库与测序

    通过配套反应与外部测序获取分子和条码信息。

  4. 04

    空间重构与分析

    结合空间条码与组织图像,研究区域表达及相应质量指标。

样本与适用范围

样本要求与首次项目评估。

组织空间与微环境研究

当前样本入口

OCT 包埋的新鲜冷冻组织。送样前结合组织形态、RNA 质量、尺寸与切片条件讨论预实验。

固定发生在哪一步?

样本要求与流程内固定是两件事:来样须为未固定的新鲜冷冻组织;切片上机后,流程本身包含固定步骤。当前方案不接收已固定或石蜡包埋样本。

如何规划首次项目?

先确认研究区域与样本适配,再讨论切片、成像、实验和分析条件。空间 RNA 服务处于优化阶段,按项目评估实施。

评估空间研究项目

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